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什么是GO富集分析,常说的GO功能分析、功能分析、PAthwAy分析是什么意思?

Gene Ontology可分为分子功能(Molecular Function),生物过程(biological process)和细胞组成(cellular component)三个部分.蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对于到Term,即功能类

芯片分析中的go分析解读 :1. 基因本体(gene ontology),简称GO,是一种描述基7a686964616fe58685e5aeb931333361303065因或基因产物基本特性的词汇,由基因本体协会开发.2. GO数据库在建立注释基因和蛋白质知识的标准词汇体

一直都搞不清楚这两者的具体区别,只知道是将基因富集到代谢上.前者是功能注释,即每个基因可能参与哪些pathway terms 或者 GO terms,没有阀值的. 后者是功能富集,即基因集(多个基因)可能显著的集中在哪些功能上面例如选择P<0.

基因富集分析是分析基因表达信息的一种方法,富集是指将基因按照先验知识,也就是基因组注释信息进行分类.

rich factor 丰富的因素重点词汇释义factor因素; 因子; 代理人; 把…因素包括进去; 分解…的因子,将…分解成因

GO是Gene Ontology的简称,是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目,从分子功能(molecular function)、生物学过程(biological process)和细胞定位(cellular component)三个面对基因功能进行全面定义;下面有个详细介绍,你可以参考下.http://www.bbioo.com/lifesciences/40-114604-1.html

1.Pathway功能析及显著性判断 差异表达基进行Pathway功能析并计算Pvalue进行显著性判断Pvalue越表明该pathway变化越显著并每条Pathway通路图进行展示同相应位置标注差异表达基 2.Pathway基相关性析 根据每两基共现同pathway数统计绘

这种东西是看不出来是否判断与肿瘤有关的,肿瘤本身具有远端转移特性,从各个组织中都有可能存在.所以如果想要看pathway是否与肿瘤相关,就需要点进去查看相关文献,把各种蛋白摸透,才能够搞定,如果仅仅凭借go数据库的pathway来的就能判断了,世界早就和平了~多看看文献吧,加油.

1. Pathway功能分析及显著性判断 对差异表达基因进行Pathway功能分析,并计算Pvalue进行显著性判断,Pvalue越小,表明该pathway变化越显著,并可对每条Pathway通路图进行展示,同时在相应的位置标注差异表达基因. 2. Pathway中基因

富集度又称加浓度.富集铀中235U的丰度.按富集度富集铀可分成低富集(低浓)、中富集(中浓)、高富集(高浓)和超富集(超高浓)铀. 各国对富集铀的划分标准不尽相同,根据国际原子能机构 (IAEA) 规定,235U含量小于20%为低富集铀.不同富集度的富集铀用途不同,一般轻水堆的燃料富集度在5%左右,快堆(如钠冷快堆)的燃料富集度较高,为20%左右.而用于武器的富集度至少在90%以上.

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